
En noviembre de 2007 el Centro de Microdatos fue distinguido como un Centro de Excelencia por la Iniciativa Científica Milenio, luego de que el proyecto presentado fuera calificado como sobresaliente en el primer concurso abierto a proyectos de Ciencias Sociales organizado por el Ministerio de Planificación.
Este reconocimiento, que otorga un financiamiento basal por tres años a partir de 2008 y que es renovable por otro período equivalente, ha contribuido a consolidar el trabajo ya realizado en términos de investigación y publicaciones, a partir del uso de datos de panel que el Centro ha recolectado en áreas de educación, trabajo, seguridad social, salud y empresas.